是皇帝咨政机构，此后权力逐渐增大，后形成为明朝行政中枢，位于六部尚书之上。
然而，虽然首席内阁大学士（或称内阁首辅）有票拟的权力，但却不得不依赖于内部太监送达批红，这种内廷、外廷相互制约，时常造成了内外两大政治势力的争权夺利，以致明代成了宦官为祸最烈的朝代。
郑成功多方思考，以及参考中外历史，决定改良内阁六部职责。
首先是细化六部的职责，吏部分化为组织部、人力资源部；
户部分化为财政部、民政部、农业部、工商管理部；
礼部分化为外交部、教育文化部、卫生部；
兵部分化为国防部；
刑部分化为司法部、公安部；
工部分化为工程建设部、水利交通部；
御史台（都察院）分化为检察院、立法院，
在细分六部职责的同时，郑成功加强了内阁的权利。
虽然郑成功有开府之权，但只有任命自己府下六部的权利，无权任命内阁大学士。
连嘉奖自己的老师钱嫌益，也只能上报永历帝，由他下旨册封。
郑成功继续保持内阁制，只是名称上不再是内阁大学士，而叫