栖霞县、招远县、莱阳县、宁海州、文登县等地方官府。
同时置有卫、所、寨、关等军事机构。
为扼守战略要冲，登州府府治位蓬莱，城近乎于方形，依山临海而建，因此则蓬莱城轮廓并不规整。
城有四门，东为春生门，南为朝天门，西为迎恩门，北为镇海门，内设瓮城。
蓬莱以东西门间大街为干道，干道两侧建有万寿宫、军器局和文昌祠等，在偏西跨街建有鼓楼，这按察分司就建立于此。
作为监督、巡察登州府政治、司法等情况，登州府立有分巡道。
与按察分司相差不远，登州府府衙便建造于此，距迎恩门不远。
在登州府府衙正对通道的两侧，分别建有府学、税课司、观音堂，大东书院、关帝庙、布政司、城隍庙、开元寺等。
为确保一府之城固守安定，在城外西北角紧邻水师要塞，有小城一座名备倭城。
因毗邻海域，故登州府境有水师驻守，所以这濒临海域的卫、所、寨，皆受其节制！
但又因赵宗武身负皇命，前往辽东组建东海镇指挥使，并节制大明东海境内一切水师，故从东海镇创建之时，蓬莱水师营就将归属于东海镇节制！