允许暂借台湾作为货物的中转站，为期二十年，租金免除但要以两千支燧发枪和八门长管炮作为贡品，三年内作为贡品入京。其余贡品十年一贡，但允许朝贡之外在福建和广东进行贸易。
特许五人的名额进入南京国子监读书，给予一些人路引允许他们周游各地，允许陈健等人在北京择地居住，购买房屋或是兴建学堂。
任命了一人以归化之民的身份，加入钦天监，作为九品的五官司历，并要求礼部编纂新的历书，实则是东林趁机打击齐楚浙党一派的人。
陈健以西藩宣慰使司的身份，名义上有拥有宣慰台湾的资格，每年缴纳一千五百两白银的羁縻差发。此职位非世袭，但具体的官职人物由陈健这边决定，定下来后上报明廷，得到官方许可认证。
允许陈健在月港进行贸易，船上进出口货物按照估价大约征收百分之三的税。进入内河的货物征收百分之八的税，以印花为记，沿途不再需要缴纳其余税费。
每艘返回月港的贸易船只，必须携带五十石稻米，此稻米免税，平价征收。
不得与日本进行贸易。不得雇佣倭人作为私兵或是私奴。
允许陈健在琉球到台湾之间巡航游弋，如遇到倭寇劫掠有出兵