和历史上的太平天国南京大决战一样，太平军十分重视南京北大门九洑洲的战略地位，李秀成还没有回师南京之前，洪秀全和蒙得恩就已经派遣南京城中最会打水战的敛天义梁凤超率领一万多精锐驻守九洑洲，数量不多的南京太平军战船和大量强征来的民船也全部转移到了狭窄的九洑洲北航道中，以此确保南京太平军和长江北岸的联络。
梁凤超也没让洪秀全等人失望，那怕是在吴军水师徐来部屯兵大胜关期间，由梁凤超负责指挥的太平军水师仍然还是没有让南京太平军和江北太平军失去联系，还多次冒险护送运兵运粮船只横渡长江，在吴军水师的眼皮子底下给南京战场送来了不少的江北粮食。吴军冯三保部一度北上佯攻江浦时，梁凤超所部也以严密的防守让吴军水师知难而退，没敢乘势向九洑洲发起进攻。
当然，这些也和当时的吴军战略目的有关，当时吴军最大的目的是向南京太平军施压，逼着李秀成尽快回师南京为上海吴军分担压力，没兴趣也没精力时间去收拾九洑洲太平军，不然的话，以吴军当时的水陆实力，一定要拿下九洑洲也不是绝对做不到。
不过吴军的暂时忍让又造成了一个后果，就是让梁凤超认为自己有足够的把握可以守得住九洑洲，用不着