受限于兵力数量，吴超越只能是选择在南京西城诸门外每门驻扎两个营一千人，建立防御工事和埋设地雷当道拦截太平军的出城道路，以单薄兵力封堵敌人，好在有秦淮河帮忙，既可以帮着挡路，又可以让吴军水师的舢板船队快速机动作战，所以吴军在南京西城的兵力虽单，却也勉强够用，还能在包围敌人的同时腾出手发起攻城，向东城敌人施加压力。
压力最大的是吴军冯三保兵团，南京的东门外没有类似秦淮河和玄武湖之类的天险拦道，地势又十分开阔，很容易被太平军突围得手，再加上冯三保兵团的装备和单兵素质都比较差，所以冯三保只能是采纳自己兵团里的湘军老人的建议，征调大量的百姓民夫，挖掘一道从孝陵卫到秦淮河的大型壕沟补强防御，结果吴超越虽然没有反对冯三保用这个笨办法封锁敌人，吴军却因此耗费了大批的钱粮，加重了后勤的负担。
只负责封锁神 策门和太平门的吴军曹炎忠兵团在防御方面压力最轻，然而在分兵攻打位于紫金山上的太平军据点天堡城时，吴军将士却遭到了守垒敌人的顽强抵抗，多次进攻都被太平军打退，连续打了两天都没能拿下天堡城，相反还付出不小的死伤代价。
两天都没能打下天堡城的主要原因有两个，