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在解决了血袭者同盟的舰队之后，星际联邦的舰队就把目标放在了几乎没什么战斗力的共济会舰队之上。
因为秦浩刺杀了塔里图夫，并且利用他的身份扰乱了整个共济会舰队的秩序，导致整个共济会舰队都失去了战斗力。
虽然大部分共济会舰船都从秦浩的手中，又夺回了控制权，但他们也只能纯手动驾驶，因为一旦启动舰载系统，那么战舰就会重新接受旗舰的指挥。
这些比较有能力的舰长，他们在夺回战舰的控制权之后，第一想做的当然是要撤出战场了，对此秦浩虽然做了一些干扰，但因为这些战舰都跟旗舰切断了联络，所以他们也没有受到太大的影响。
而星际联邦舰队之前的注意力都在血袭者同盟的舰队身上，为了不受额外的损失，所以星际联邦舰队根本没管已经残了的共济会舰队，他们专心的消灭了血袭者同盟的所有战舰。
趁着这段时间，共济会的大部分战舰都开始脱离战场，希望能够逃出这片炼狱，但有个问题是他们无法解决的，那就是相位引擎的启动，是需要舰载系统来控制的。
因为进入相位空间，并且在相位空间中穿梭是需要大量计算