安后，盗用天子车服，并命尚书以下众官有子皆至其相府禀报。又以其弟董文为左将军，从子董璜为侍中、中军校尉，皆典兵事。大封其宗族，董氏襁褓中婴儿皆得封，男皆封侯，女为邑君。董仁和董婉他们一家皆得封赏。董卓又于长安筑郿坞，高、厚各七丈，其中积谷可用三十年。
董卓残暴好杀，诸将稍有言语差失，立即处死，又以叛逆之名，大杀关中旧族。他倒行逆施引起朝臣强烈不满。司徒王允、司隶校尉黄碗、尚书杨瓒等密谋杀掉董卓，董卓自知为人所怨，出入常以骁勇过人的中郎将吕布作护卫。
王允便让自己的义女任红昌勾引吕布，吕布甚爱之，欲纳任红昌为妾。不料王允已将任红昌献与了董卓，吕布与任红昌私会时被董卓撞见，董卓欲杀吕布，吕布心生嫌怨，告诉司徒王允。
王允等见时机来到，遂劝吕布杀董卓，为天下除害。初平三年四月，献帝有病初愈，众臣朝会于未央殿。董卓乘车而入，以兵护卫在道旁，并使吕布随车卫护。王允使尚书仆射士孙瑞写诛卓诏书交付吕布。吕布令同乡骑都尉李肃带勇士十余人扮作卫士埋伏于朝门内，董卓进来，李肃一戟将其刺倒，吕布随即将董卓刺死。
董卓死后，长安兵民百姓相庆于道，卫士皆呼