当日本的部队在装甲车和坦克车的掩护下开进城之后。幸存的中国军队，与之展开了烈的巷战。战斗断断续续持续了有一周多的时间。
许多中国军人躲在倒塌了一半的房屋里，用它做掩体，打伏击可是却被坦克车已发炮弹，打的连掩体都不见了。为了能炸毁一辆坦克车，往往要牺牲十几个人的性命，才能炸断坦克车的履带，使之瘫痪下来。但是坦克车又经过几个小时的修理，再次重新发动了起来。
中国军人的顽强的抵抗，也让小鬼子付出了惨痛的代价，每一次的伏击，都会损失五到十名士兵。这大大刺激的小鬼子。
所以从第二天开始，小鬼子在坦克车、装甲车的掩护下，自城北到城南，展开地毯式的搜索，只要看到中国军人，直接开枪打死。
不过幸运的是，因为南京城早已经尘土飞扬，落到人的身上形成一层厚厚的伪装，也降低了南京城里的能见度。使小鬼子的搜素的难度大大提高。后来，中国军人利用这一点，一次又一次的伏击小鬼子，而大获全胜。
但是也正因为如此，也造成了小鬼子的误杀。后来小鬼子，索性只要看到活人就开枪，不管你是平民还是军人，只要你能动，我就开枪。甚至，还有小鬼子把逃难的市民，集体驱赶到