管束极其严格。
只要葡萄牙人稍有不服，明廷便是大军压境，强行拆毁葡萄牙人的房屋和建筑，以此来达到压制的目的。
除此之外，朝廷规定，居住在澳门的葡萄牙人每年要缴纳至少五百两的地租银，而且还必须接受地方官员和官府衙门的管辖，最出名的便是中国县令对葡萄牙人用刑一事，其实这是个导火索。
澳门人十分不服气，因此，明葡双方在澳门附近爆发了多次冲突，其中就包括了比较大规模几次海战，但当时的万历朝军备充裕，无一例外，这些冲突都是以葡萄牙人的惨败而告终。
数次冲突获胜以后，万历皇帝正式向葡萄牙国王致信，并且对留在澳门的葡萄牙人发布诏令，明文规定：
“尔等在澳居住之人，既在天朝地方，即应尊奉天朝法度，否则，必重治尔等之罪，不能宽恕。”
随即，葡萄牙国内出台了相关政策，规定留澳居住的葡萄牙人必须遵行明朝的制度，否则，将予以遣返回国的严惩。
除此之外，葡萄牙方面又规定，每任赴澳上任的葡澳总督须得遵行葡明双方互惠之原则，“世世沐浴天朝圣恩，坚守臣节誓不移。”
长期以来，由于明朝方面的强势，葡萄牙人都是