为崇祯皇帝愈发觉得这东林党实在是有他的过人之处，就好像后世的传销组织一样，短时间内根本难以彻底清除。
这传销组织堂而皇之的发展到了朝堂之上，尽管东林大佬们杀的杀、逃的逃，可那些小辈后生仍是喊着忠君为国的口号前仆后继，就连崇祯皇帝自己都不知道，彻底诛灭东林到底需要多久。
一方面持续诛灭东林，另一方面，崇祯皇帝也开始着手在朝堂上建立自己的嫡系。
自崇祯十七年开始，朝廷连续启用冯铨、郭尚友、王绍微等一批在崇祯元年遭“阉党”之变削职的大臣，但令人意外的是，魏藻德还是首辅。
此后，冯铨入阁，绍微得任天官，尚友乃为提督，此时皇党初显，而诛灭八大晋商，夷钱谦益十族，蒋德璟进位，魏藻德功退，则是皇党勃兴执政之始。
崇祯皇帝在时次辅蒋德璟的建议下重新启用郭尚友，叙列往功，充为南京京营提督大臣，掌南京京营之兵马、钱粮、分配等诸事。
南京兵部尚书一职自史可法调任都察院御史以来一直空缺，朝廷也没有明旨任命其他人不缺，可是实际上，郭尚友、周经武和马士英三个人，却已经掌握了南京城全部的兵马城防。
崇祯皇帝任命郭尚友之