郑芝龙见此子好学，便花费重金，拖带关系送他进入金陵国子监求学。
当时的金陵，还是东林党老巢，南京六部和国子监还都健在，郑芝龙如此大费周章让他来此求学，自然要找声名最显赫之人，这一来二去的，拜师不免就拜到了钱谦益头上。
对于庞然大物一般的郑氏，钱谦益是不敢有所怠慢的。
说起来，郑森这个名字还是钱谦益替他起的，到金陵之前，郑家人包括郑鸿奎都称他做郑福松，这也成了如今郑森的小名，乳名。
直到如今，郑鸿奎私下里依旧称呼他为“福松”。
据钱谦益当时的说法，“森”代表着深沉整肃，丛众茂盛之意，之后，他又替郑森起了新的表字，唤做“大木”，同样是为了让郑森勤奋好学，熟读四书五经等经典。
郑芝龙很满意他替自己儿子找的这个老师，但郑森却并不是很满意，处于最基本的尊敬，他开始跟从钱谦益学习儒家学问。
直到崇祯十九年，声名显赫的东林魁首钱谦益因拥立新君事泄被诛，崇祯皇帝亲自下旨，将他十族夷尽，抄家灭族，其本人亦被活剐三千多刀，凌迟处死。
这件事震惊了整个士林，三厂一卫全力开动，番子、锦衣卫们