在朝堂中的势力极大，内阁中的工部尚书吴淳夫就是他的“提线木偶”、还有南京兵部尚书崔呈秀等人做他的帮凶，虽然魏忠贤几乎全盘把持了朝政，但他最顾忌的就是两个人。
一个就是信王朱由检，这个是天启皇帝的弟弟，两个人从小玩到大，感情深厚，现在天启皇帝又把他立为皇位继承人，魏忠贤曾经几次找机会离间天启皇帝和信王的兄弟情，可是天启皇帝是个念亲情的人，他根本不相信信王会反对他，所以就算魏忠贤心里就算再反感信王，也拿他没法；
另一个就是兵部尚书孙承宗，这个是天启皇帝的师傅，资格老、学问高而且不像一般的书呆子只会“高谈阔论”，朝堂中公认孙承宗是懂军事的人，天启皇帝也格外看重他，派孙承宗到辽东镇守，对孙承宗兵马粮饷方面的要求，也是大力支持。
孙承宗也确实给天启皇帝挣气，宁远、锦州打了几次胜仗，扭转了大明王朝对满清一败再败的颓势，赢得朝野一致赞赏。魏忠贤也是个聪明人，看到孙承宗在朝堂上的风头正盛，便几次三番地表达了对孙承宗的欣赏之情，想拉孙承宗入伙，然而孙承宗一向以“清流”自居，打心眼里看不起魏忠贤这个阉人，便拒绝了他的拉拢。
信王朱由检、兵部尚书孙承宗