关系来说明人体的组织结构、生理功能、病理变化疾病的诊断和治疗以及确定治疗原则。
五元学说成为蒙医学理论体系的纲要，分别归属于土、水、火、气、空。蒙医学认为人体是一个统一的有机整体，其各个部分之间都有密切联系，这种相互联系和构成，均和五大元素密切相关。
三根是人体赖以进行生命活动的三种能量和基本物质赫依、希拉、巴达干的简称。
三根的功能不仅表现在正常的生理活动中，同样也表现在异常的病理变化中。
七素为构成人体的基础物质饮华、血、肉、脂肪、骨、骨髓及。
七素在有机整体的内部运动中属阴性范畴，有显示人体第二特性的作用。
七素内部也存在着引起矛盾运动的因素。
所谓的三秽，指人体吸收食物的养分后，污物、残渣以大便的形式排出体外；存在于人体内的糟粕以尿的形式排出；汗液能使皮肤润洁，起固表的作用。
病理学是以阴阳学说为主导，以人体基本组成部分之五元、三根七素的相对抗关系为基础，研究发病原因、因素、病变过程，同时分析研究病因、发病部位及疾病本质的学科。
诊断学是蒙医学的重要组成