遣使召来护儿率军返回。来护儿认为此时正是攻破高句丽的好机会，想继续进攻，不肯奉诏，但是无奈诸将还是听从杨广的命令，都请求返回，来护儿只好奉诏退军返回隋朝。
八月份，隋炀帝从怀远镇班师回朝，这时，邯郸贼帅杨公卿率领其手下八千余人劫掠了杨广车驾后的第八队，得到了飞黄上厩马四十二匹。
十月份，丁卯时，杨广到达东都，己丑时，到达了西京。当他下令要高句丽的君王高元入朝觐见，高元却始终没有来，杨广气急败坏，却也无可奈何。
这第三次讨伐高句丽，双方几乎未动一兵一卒，不过杨广表面上取得了胜利，可实际上却还是败给了高句丽的诈降之计，最严重的是隋朝的兵民已经对杨广的统治极度不满。