留都南京对大明朝而言，更具象征意义，然而实际意义不大，崇祯从朱棣在皇明卷宗上的密辛得知，当时成祖皇帝选择北京的原因很多，两京制不过是他的借口罢了。
首先一个，明朝南、北“两京制”形成后，北京作为政治、军事中心，南京作为经济和文化中心，很长一段时间，南北达到一种微妙的平衡。
其实崇祯皇帝也觉得该有第二个都城，以备后患，不过六部和那么多无用的官署只是为了留一个备份的朝廷，实在是弊端大而用处小。
并且这最大的一个用处，在历史上的明末却也根本没有用得上。
设想一下，如果大明在只在南京设立一个都城，那么政治、军事、经济、文化中心都在南京，中国北方将持续凋敝下去，很不利于一个大帝国的统一与稳定。
若只设在北京，道理也是一样。
朱温灭唐，经五代十国大乱后，中国的政治格局从东、西竞争变成了南、北竞争。
无论是周武王东征灭商，秦始皇灭六国一统天下，还是刘邦以汉中为根据地取得天下，或是隋、唐两朝依据关陇集团统一中国，关中一直是统治者的根本重地。
这些历朝历代的帝王，他们针对西北要重点防范