商周祚给天启皇帝的奏折中写道：“荷夷突驾五舟犯我六敖。六敖逼近漳浦，势甚岌岌。该道程再伊、副总兵张嘉策多方捍御。把总刘英用计沈其一艇，俘斩十余名。
中左所（今属厦门）为同安、海澄门户，洋商聚集于海澄，夷人垂涎。又因奸民勾引，蓄谋并力，遂犯中左，盘据内港，无日不搏战。又登岸攻鼓浪屿，烧洋商黄金房屋船只。已遂入泊圭屿，直窥海澄。我兵内外夹攻，夷惊扰而逃。已复入厦门，入曾家澳，皆实时堵截，颇被官兵杀伤。”
商周祚应对荷兰人进攻毫无章法，引起天启皇帝的不满，于是火速换上了南居益，南居益到福建后，很快发现局面不容乐观，南居益在给天启皇帝的奏章中提及：“红夷倡乱已占据彭湖，又筑城营垒，伪立不拔之基。乘汛出没，虏掠商艘，焚毁民庐，杀人如麻，与国为敌。沿海震惊，官兵观望，但恃抚谕一道，以图徼幸。而海上奸民，且利夷金钱，交通接济。法纪既已荡然，封疆几为沦没。当时南北台省交章论闽事者，无不谓东南半壁，岌岌乎有荐食之卢矣。”
南居益又描述荷兰舰队的战船道：“舟长二十余丈、高数丈，双底。木厚二尺有咫，外鋈金锢之。四桅，桅三接，以布为帆，……中横一杆，桅上有斗，